Na sua longa vida sacerdotal trabalhou no Seminário de Leiria, de Outubro de 1955 a Setembro de 1996, onde foi educador e professor de muitas gerações de sacerdotes. Em 1976 foi nomeado cónego da Sé de Leiria, igreja em que regia o respectivo coro e conduzia a animação musical das celebrações litúrgicas. Também no Santuário de Fátima regeu o canto da assembleia ao longo de muitos anos.

Exerceu ainda as tarefas de director diocesano da Obra Pontifícia da Propagação da Fé, professor de Religião e Moral no Liceu Nacional de Leiria, conselheiro espiritual das Equipas de Nossa Senhora, membro do Secretariado Diocesano de Liturgia e da Equipa sacerdotal do Movimento dos Cursos de Cristandade.

Uma parte substancial das suas obras musicais foi reunida no livro “Orar Cantando”, publicado em 2001 pelo Secretariado Nacional de Liturgia. Com a sua criatividade e dotes musicais, o Cónego Carlos Silva cantou e ensinou a cantar os louvores de Deus, empenhando-se em promover em todos os fiéis uma “participação activa, consciente e frutuosa” nas celebrações litúrgicas.